仪器简介:该测序仪采用的Roche GS System是一种基于焦磷酸测序原理而建立起来的高通量基因组测序系统,开创了边合成边测序的先河。该测序仪测序结果数据质量高,分析简单,突出优势是读长,与易用的分析工具相结合。该测序仪使第二代测序触手可及,不再局限于大型机构和高昂的项目经费及苛刻的基础设施。
性能特点:
1.属第二代测序技术,能够从小分子RNA到真核细胞基因组测序。
2.测序片段平均读长可达400到500 bp
3. 运行时间短速度快:单次运行时间10小时(测序与分析同时进行)
4. 高通量:单次运行可获得10万条读长序列,35M以上高质量过滤后碱基数据
5. 准确度高,达到 99.9%,认可度高。
6. 自动化数据分析(拼接、比对、突变分析),数据解读方便,后续分析简单,不需建立庞大的生物信息团队,2小时完成数据处理。
7. 长读长:读长范围为50_600bp,甚至更长。
8. 多类型突变,低频率检出。
9. 单克隆:完整区分每一条PCR产物、直接进行单倍体分型(HLA)、准确判断连锁关系(病毒耐药)。
10. 实验设计灵活多样:多样本、多项目、多目标任意组合,便于Sanger技术平台的转换,减少重复testing。
11. 操作简单,对操作者经验要求低。
12. 费用低,数据分析简单,降低成本。
应用范围:
1.病原体检测
2.扩增子直接克隆测序(PCR产物)
3.疾病分子机理 (Cancer, Diabetes)
4.传染病源快速检测 (Avian flu, Swine flu等)
5.病毒抗药性研究 (HIV, HCV)
6.癌细胞突变, 基因表达 (Lung, Breast cancer)
7.人类白细胞抗原定型 (HLA)
8.分子遗传诊断
9.DNA甲基化
10.转录组研究